מדרשת שוהם הוקמה על ידי הרב דוד סתיו, רב היישוב, מתוך מגמה להעמיק את ההיכרות של הקהילה בשוהם עם עולם התוכן היהודי, באופנים חווייתיים, בלתי אמצעיים, מגוונים וקצת פחות קונבנציונאליים. המדרשה שמה לה למטרה להפגיש את הדור הצעיר עם המורשת היהודית בגובה העיניים ומתוך כבוד לקבוצות האוכלוסייה השונות ביישוב.